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Cy7是一种近红外花青素荧光染料。由于它的荧光波长（Em：770nm）恰好处于肌体组织近红外窗口I的区域（肌体的血液，体液和组织此区域背景荧光弱，而长波长穿透性强），所以Cy7常常应用于小动物活体体内成像中。Cy7荧光肉眼不可见，并且显微镜观察时需要近红外滤片，很多荧光显微镜（包括共聚焦显微镜）并不配备，但是流式细胞仪（flow cytometry）常常配备Cy7滤片组。Cy7是常用荧光染料，Cy7可以用来标记核酸，蛋白，抗体，多肽等，它是最常见的小动物显影剂之一。

NHS活化酯（N-羟基琥珀酰亚胺酯，N-hydroxysuccinimide ester，succinimidyl ester）是生物标记反应中最常用的活化基团。它活化Cy7分子中的羧基，让它可以和目标生物分子上的胺基（伯胺或者仲胺）反应生成稳定的酰胺键，从而把Cy7分子标记到生物大分子上。由于游离胺基是蛋白，抗体，多肽表面的常见官能团（来自于赖胺酸侧链），Cy7-NHS可以和它们直接反应。核酸分子中天然不带游离胺基，只有胺基修饰过的RNA或者DNA才可以和Cy7-NHS反应。另外，Cy7-NHS也可以标记聚合物胺基，纳米粒表面胺基等。

Cy7-NHS活化酯的水溶性较低，所以在水相的标记反应体系内需要使用有机共溶剂，常用有机溶剂包括DMF，DMSO和乙腈等。如需标记的分子对有机溶剂敏感，可选择磺化花青素（sulfonated cyanine），即sulfo-Cy7-NHS活化酯。两者的光谱性质几乎一致，因此大部分应用可相互替换。两者的主要区别在于：磺化染料是水溶性的，在水相的标记反应体系内不需要使用有机共溶剂，并且降低染料在水中聚集的可能性，增强标记效率。

Cy7-NHS标记后的产物Ex/Em是740/770nm。和它具有相似荧光特性的染料包括Alexa Fluor 750，DyLight 755等。

CAS号	1432466-81-3(类似)
分子式	C38H44ClN3O4
分子量	642.23
结构式
光谱特性	Ex/Em＝740/770nm（MeOH/PBS）
消光系数	199000L·mol-1·cm-1
量子产率	0.3
外观	绿色固体
溶解性	易溶于DMF等有机溶剂
保存条件	避光，干燥，-20℃保存

• NHS ester基团对湿度比较敏感，务必干燥保存产品。使用前产品需放到室温回温至少20分钟。
  
• 使用不含氨基的缓冲体系。比如磷酸钠缓冲液（PBS），Hepes缓冲液，碳酸氢钠缓冲液，或硼酸缓冲液等。不要使用任何含伯胺或仲胺的缓冲液，比如Tris，甘氨酸等。高浓度咪唑(imidazole)也会影响反应。
  
• 标记反应不要放在强光下，因为大部分荧光化合物在强光下长时间照射会缓慢光漂泊。